Conservation of the TRAPP II-specific
subunits of a Ypt/Rab exchanger complex
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Taxonomy of Organism Used in this Paper
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A_Ag
root
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cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
;
Eumetazoa
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Bilateria
;
Coelomata
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Protostomia
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Panarthropoda
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Arthropoda
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Mandibulata
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Pancrustacea
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Hexapoda
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Insecta
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Dicondylia
;
Pterygota
;
Neoptera
;
Endopterygota
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Diptera
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Nematocera
;
Culicimorpha
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Culicoidea
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Culicidae
;
Anophelinae
;
Anopheles
;
Cellia
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Pyretophorus
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gambiae species complex
;
Anopheles gambiae
;
Anopheles gambiae str. PEST
A_Am
root
;
cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Eumetazoa
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Bilateria
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Coelomata
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Protostomia
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Panarthropoda
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Arthropoda
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Mandibulata
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Pancrustacea
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Hexapoda
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Insecta
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Dicondylia
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Pterygota
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Neoptera
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Endopterygota
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Hymenoptera
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Apocrita
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Aculeata
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Apoidea
;
Apidae
;
Apinae
;
Apini
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Apis
;
Apis mellifera
A_Bt
root
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cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Eumetazoa
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Bilateria
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Coelomata
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Deuterostomia
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Chordata
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Craniata
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Vertebrata
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Gnathostomata
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Teleostomi
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Euteleostomi
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Sarcopterygii
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Tetrapoda
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Amniota
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Mammalia
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Theria
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Eutheria
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Laurasiatheria
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Cetartiodactyla
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Ruminantia
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Pecora
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Bovidae
;
Bovinae
;
Bos
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Bos taurus
A_Cb
root
;
cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Eumetazoa
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Bilateria
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Pseudocoelomata
;
Nematoda
;
Chromadorea
;
Rhabditida
;
Rhabditoidea
;
Rhabditidae
;
Peloderinae
;
Caenorhabditis
;
Caenorhabditis briggsae
A_Ce
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Metazoa
;
Eumetazoa
;
Bilateria
;
Pseudocoelomata
;
Nematoda
;
Chromadorea
;
Rhabditida
;
Rhabditoidea
;
Rhabditidae
;
Peloderinae
;
Caenorhabditis
;
Caenorhabditis elegans
A_Cf
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Eumetazoa
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Bilateria
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Coelomata
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Deuterostomia
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Chordata
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Craniata
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Vertebrata
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Gnathostomata
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Teleostomi
;
Euteleostomi
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Sarcopterygii
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Tetrapoda
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Amniota
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Mammalia
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Theria
;
Eutheria
;
Laurasiatheria
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Carnivora
;
Caniformia
;
Canidae
;
Canis
;
Canis familiaris
A_Dm
root
;
cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Eumetazoa
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Coelomata
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Protostomia
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Panarthropoda
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Arthropoda
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Mandibulata
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Pancrustacea
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Hexapoda
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Insecta
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Dicondylia
;
Pterygota
;
Neoptera
;
Endopterygota
;
Diptera
;
Brachycera
;
Muscomorpha
;
Schizophora
;
Acalyptratae
;
Ephydroidea
;
Drosophilidae
;
Drosophilinae
;
Drosophilini
;
Drosophilina
;
Drosophiliti
;
Drosophila
;
Sophophora
;
melanogaster group
;
melanogaster subgroup
;
Drosophila melanogaster
A_Dp
root
;
cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Eumetazoa
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Bilateria
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Coelomata
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Protostomia
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Panarthropoda
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Arthropoda
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Mandibulata
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Pancrustacea
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Hexapoda
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Insecta
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Dicondylia
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Pterygota
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Neoptera
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Endopterygota
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Diptera
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Brachycera
;
Muscomorpha
;
Schizophora
;
Acalyptratae
;
Ephydroidea
;
Drosophilidae
;
Drosophilinae
;
Drosophilini
;
Drosophilina
;
Drosophiliti
;
Drosophila
;
Sophophora
;
obscura group
;
pseudoobscura subgroup
;
Drosophila pseudoobscura
A_Gg
root
;
cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Eumetazoa
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Bilateria
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Coelomata
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Deuterostomia
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Chordata
;
Craniata
;
Vertebrata
;
Gnathostomata
;
Teleostomi
;
Euteleostomi
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Sarcopterygii
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Tetrapoda
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Amniota
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Sauropsida
;
Sauria
;
Archosauria
;
Aves
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Neognathae
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Galliformes
;
Phasianidae
;
Phasianinae
;
Gallus
;
Gallus gallus
A_Hs
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Metazoa
;
Eumetazoa
;
Bilateria
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Coelomata
;
Deuterostomia
;
Chordata
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Craniata
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Vertebrata
;
Gnathostomata
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Teleostomi
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Euteleostomi
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Sarcopterygii
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Tetrapoda
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Amniota
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Mammalia
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Theria
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Eutheria
;
Euarchontoglires
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Primates
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Haplorrhini
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Simiiformes
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Catarrhini
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Hominoidea
;
Hominidae
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Homo/Pan/Gorilla group
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Homo
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Homo sapiens
A_Mm
root
;
cellular organisms
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Eukaryota
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Fungi/Metazoa group
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Metazoa
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Craniata
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Vertebrata
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Gnathostomata
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Teleostomi
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Euteleostomi
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Sarcopterygii
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Tetrapoda
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Amniota
;
Mammalia
;
Theria
;
Eutheria
;
Euarchontoglires
;
Glires
;
Rodentia
;
Sciurognathi
;
Muroidea
;
Muridae
;
Murinae
;
Mus
;
Mus musculus
A_Tc
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Metazoa
;
Eumetazoa
;
Bilateria
;
Coelomata
;
Protostomia
;
Panarthropoda
;
Arthropoda
;
Mandibulata
;
Pancrustacea
;
Hexapoda
;
Insecta
;
Dicondylia
;
Pterygota
;
Neoptera
;
Endopterygota
;
Coleoptera
;
Polyphaga
;
Cucujiformia
;
Tenebrionoidea
;
Tenebrionidae
;
Tribolium
;
Tribolium castaneum
A_Xl
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Metazoa
;
Eumetazoa
;
Bilateria
;
Coelomata
;
Deuterostomia
;
Chordata
;
Craniata
;
Vertebrata
;
Gnathostomata
;
Teleostomi
;
Euteleostomi
;
Sarcopterygii
;
Tetrapoda
;
Amphibia
;
Batrachia
;
Anura
;
Mesobatrachia
;
Pipoidea
;
Pipidae
;
Xenopodinae
;
Xenopus
;
Xenopus
;
Xenopus laevis
Al_Tt
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Alveolata
;
Ciliophora
;
Oligohymenophorea
;
Hymenostomatida
;
Tetrahymenina
;
Tetrahymenidae
;
Tetrahymena
;
Tetrahymena thermophila
;
Tetrahymena thermophila SB210
F_Af_
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Eurotiomycetes
;
Eurotiales
;
Trichocomaceae
;
mitosporic Trichocomaceae
;
Aspergillus
;
Aspergillus fumigatus
;
Aspergillus fumigatus Af293
F_Ag
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Saccharomycotina
;
Saccharomycetes
;
Saccharomycetales
;
Saccharomycetaceae
;
Eremothecium
;
Eremothecium gossypii
;
Ashbya gossypii ATCC 10895
F_An
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Eurotiomycetes
;
Eurotiales
;
Trichocomaceae
;
Emericella
;
Emericella nidulans
;
mitosporic Emericella nidulans
;
Aspergillus nidulans FGSC A4
F_Ao
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Eurotiomycetes
;
Eurotiales
;
Trichocomaceae
;
mitosporic Trichocomaceae
;
Aspergillus
;
Aspergillus oryzae
F_Ca
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Saccharomycotina
;
Saccharomycetes
;
Saccharomycetales
;
mitosporic Saccharomycetales
;
Candida
;
Candida albicans
;
Candida albicans SC5314
F_Cg
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Sordariomycetes
;
Sordariomycetidae
;
Sordariales
;
Chaetomiaceae
;
Chaetomium
;
Chaetomium globosum
;
Chaetomium globosum CBS 148.51
F_Cg1
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Saccharomycotina
;
Saccharomycetes
;
Saccharomycetales
;
mitosporic Saccharomycetales
;
Candida
;
Candida glabrata
;
Candida glabrata CBS 138
F_Ci
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Eurotiomycetes
;
Onygenales
;
mitosporic Onygenales
;
Coccidioides
;
Coccidioides immitis
;
Coccidioides immitis RS
F_Cn
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Basidiomycota
;
Hymenomycetes
;
Heterobasidiomycetes
;
Tremellomycetidae
;
Tremellales
;
Tremellaceae
;
Filobasidiella
;
Filobasidiella neoformans
;
mitosporic Filobasidiella neoformans
;
Cryptococcus neoformans var. neoformans
;
Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21
F_Dh
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Saccharomycotina
;
Saccharomycetes
;
Saccharomycetales
;
Saccharomycetaceae
;
Debaryomyces
;
Debaryomyces hansenii
;
Debaryomyces hansenii var. hansenii
;
Debaryomyces hansenii CBS767
F_En
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Eurotiomycetes
;
Eurotiales
;
Trichocomaceae
;
Emericella
;
Emericella nidulans
F_Gz
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Sordariomycetes
;
Hypocreomycetidae
;
Hypocreales
;
Nectriaceae
;
Gibberella
;
Gibberella zeae
;
Gibberella zeae PH-1
F_Kl
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Saccharomycotina
;
Saccharomycetes
;
Saccharomycetales
;
Saccharomycetaceae
;
Kluyveromyces
;
Kluyveromyces lactis
;
Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140
F_Mg
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Sordariomycetes
;
Sordariomycetes incertae sedis
;
Magnaporthaceae
;
Magnaporthe
;
Magnaporthe grisea
;
Magnaporthe grisea 70-15
F_Nc
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Pezizomycotina
;
Sordariomycetes
;
Sordariomycetidae
;
Sordariales
;
Sordariaceae
;
Neurospora
;
Neurospora crassa
;
Neurospora crassa OR74A
F_Sc
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Saccharomycotina
;
Saccharomycetes
;
Saccharomycetales
;
Saccharomycetaceae
;
Saccharomyces
;
Saccharomyces cerevisiae
F_Sp_
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Schizosaccharomycetes
;
Schizosaccharomycetales
;
Schizosaccharomycetaceae
;
Schizosaccharomyces
;
Schizosaccharomyces pombe
F_Um
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Basidiomycota
;
Ustilaginomycetes
;
Ustilaginomycetidae
;
Ustilaginales
;
Ustilaginaceae
;
Ustilago
;
Ustilago maydis
;
Ustilago maydis 521
F_Yl
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Fungi/Metazoa group
;
Fungi
;
Ascomycota
;
Saccharomycotina
;
Saccharomycetes
;
Saccharomycetales
;
Dipodascaceae
;
Yarrowia
;
Yarrowia lipolytica
;
Yarrowia lipolytica CLIB122
M_Dd
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Mycetozoa
;
Dictyosteliida
;
Dictyostelium
;
Dictyostelium discoideum
;
Dictyostelium discoideum AX4
P_At_
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Viridiplantae
;
Streptophyta
;
Streptophytina
;
Embryophyta
;
Tracheophyta
;
Euphyllophyta
;
Spermatophyta
;
Magnoliophyta
;
eudicotyledons
;
core eudicotyledons
;
rosids
;
eurosids II
;
Brassicales
;
Brassicaceae
;
Arabidopsis
;
Arabidopsis thaliana
P_Os
root
;
cellular organisms
;
Eukaryota
;
Viridiplantae
;
Streptophyta
;
Streptophytina
;
Embryophyta
;
Tracheophyta
;
Euphyllophyta
;
Spermatophyta
;
Magnoliophyta
;
Liliopsida
;
commelinids
;
Poales
;
Poaceae
;
BEP clade
;
Ehrhartoideae
;
Oryzeae
;
Oryza
;
Oryza sativa
;
Oryza sativa (japonica cultivar-group)
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